L'Atelier Monstre

Introduction Cet article présente les principes fondamentaux des scores d'isnulation, une méthode développée par le laboratoire Dekker pour caractériser les domaines d'association topologique (TAD) dans les données Hi-C. Nous détaillons le processus de calcul et son application pratique. Définition Le score d'insulation a été introduit dans une ...

L'analyse des prédictions de structures protéiques générées par AlphaFold repose sur un système rigoureux d'évaluaiton de la confiance. Ce cadre multidimensionnel intègre le score pLDDT, la matrice d'erreur d'alignement prédite (PAE) et le score pTM. Ces métriques permettent de quantifier la fiabilité des coordonnées atomiques prédites, offrant ...

Valeur fondamentale : Analyse précise de l'état de charge protéique PROPKA, en tant qu'outil spécialisé dans la prédiction des pKa des protéines, calcule l'état de distribution des charges protéiques sous différents pH en se basant sur les informations de structure tridimensionnelle. Les valeurs de pKa (constante de dissociation acide, indicate ...